Sinds 1930 wordt de vzw bestuurd door een Raad van Bestuur. Tot in 1984 werd het beleid gevoerd door de congregatie van de Zusters van Berlaar.

In 1984 werd een nieuwe Raad van Beheer opgericht, deze zou het beheer overnemen, de nieuwbouw voorbereiden en realiseren en het nieuwe rust -en verzorgingstehuis uitbaten.

De Congregatie bleef steeds zeer sterk betrokken bij het beleid van het RVT Sint-Margaretha.

Door de toenemende complexiteit van het beleid, en de stimulerende invloed van de overheid tot samenwerking en zorgoverleg werd de integratie in de vzw Rusthuizen Zusters van Berlaar overwogen.

Sedert 1 januari 2006 is de integratie een feit en behoort het Woon- en Zorgcentrum Sint-Margaretha en de serviceflats “De Parel” tot de vzw Rusthuizen Zusters van Berlaar.

De Raad van Bestuur vergadert tweemaandelijks. Hij volgt de ontwikkelingen in de ouderenzorg op de voet, bereid de beleidsvisie voor en stippelt de te volgen beleidslijnen uit.
De directie werkt samen met haar team de beleidslijnen van de vzw uit.